スタージェンはこれまで10年以上にわたり,国立研究機関や大学における次世代シークエンシング(NGS)データの解析や研究をサポートしてきました。
近年ではとくにがんゲノムデータ解析に注力し,SNV/indel変異検出やアノテーション付与等の基本解析から,コピー数変異解析,構造変異解析,mutational signature解析,neoantigen探索,driver変異探索等の発展的な解析まで,さまざまな形でお客様をサポートしております。
また,がんゲノム解析による治療標的・バイオマーカー探索のための解析パイプラインおよび標準手順書を準備し,製薬企業様向けにNGSデータを用いた治験業務のサポートもおこなっています。
基本解析
お客様が取得されたFASTQファイルをもとに,基本的なNGS解析をおこないます。germline,somaticのどちらにも対応可能です。
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構造変異解析
ゲノム上の大規模な変化をともなう変異(構造変異)を検出します。
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driver変異探索
ゲノム上の特定の領域に特定の変異が集積する有意性を判定することにより,driver変異の探索をおこないます。
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